ЛабДАО црта будућност АИ отвореног кода за откривање лекова

Пројекат Фолдинг@хоме доспео је на насловне стране током пандемије ЦОВИД-19 због распоређивања неискоришћене рачунарске снаге за истраживање простора за претрагу савијања протеина за борбу против новог коронавируса. Оспособљавајући грађане да буду сами по себи научници, иницијатива је покренула велике симулације различитих молекуларних конфигурација протеина у дистрибуираној мрежи „уписаних“ рачунара широм света.

Ова децентрализована парадигма је најављена за окупљање људи око заједничког проблема и ефикасног прикупљања рачунарске моћи, али шта ако су рачунарска снага и инфраструктура за решавање проблема обрнути? Другим речима, шта ако би појединци могли да воде своје пројекте тако што ће искористити акумулирану рачунарску снагу алати за биолошко експериментисање да се покрену?

ЛабДАО претвара тај сан у стварност са својом ПЛЕКС платформом. ПЛЕКС је алатка командне линије отвореног кода дизајнирана да учини доступним не само рачунарске ресурсе већ и разне алате за биолошко-машинско учење (које су „БиоМЛ“ пакет у оквиру ЛабДАО-а) доступним у различитим позадинама. Било да експериментишете са пристајањем малих молекула или сопственим симулацијама савијања протеина, ПЛЕКС омогућава корисницима да користе ЛабДАО библиотеку алата, деле резултате и визуализују их за мање од пет минута.

Овај пакет алата и његова платформа која омогућава коришћење на врху су били изложени на Зузалуовом самиту Блоцкцхаин Меетс Биологи почетком априла, где је чланица ЛабДАО Цоре Теам-а Лили Хансен-Гиллис демонстрирала од почетка до краја симулацију унутрашње молекуларне динамике протеина да пронађе његову најстабилнију конфигурацију. Затим је, као самозвани „некодер“, провела публику кроз то од почетка до краја – све са рачунаром, ВиФи, ПЛЕКС-ом на командној линији и ништа више.

У ширем смислу, ЛабДАО је децентрализована платформа са омогућеном веб3 (део већег покрета „ДеСци“) посвећена стварању продуктивнијег окружења за откривање лекова на бази отвореног кода. Чинећи алате и ресурсе на врхунцу доступности ширем екосистему, ЛабДАО има за циљ да створи право окружење за транспарентна и доступна научна достигнућа. Било да елиминише потребу за истраживачима да имају сопствени хардвер или рачунарску инфраструктуру или објављују резултате експеримената на блокчејн књизи тако да се они могу обрадити и репродуцирати, организација је посвећена томе да омогући више иновација кроз сарадњу — рушење баријера узрокованих лошим употребљивост и силосед, ниша стручност.

Напори ЛабДАО-а да изгради овај ДеСци свет будућности за данас су недавно добили подстицај у виду рунде финансирања од 3.6 милиона долара од разних других ДАО-а, Инфлецтион.киз, Балаји Сринивасан и других. Овај прилив подршке ће допринети сталним напорима на изградњи софтверских алата отвореног кода и јачању истраживачког екосистема ЛабДАО-а.

Што се тиче самог ПЛЕКС-а, непосредни наредни кораци на хоризонту укључују тестирање платформе у различитим научним сарадњама, складиштење разних алата и акумулацију неопходног хардвера за подстицање БиоМЛ мреже.

Што се тиче дугорочног, можда ће следећи лек за спасавање живота током следеће велике епидемије заразне болести бити дизајниран уз моћ ПЛЕКС-а, један по један децентрализовани корак напред. Како екосистем наставља да расте, само ће време показати.

Хвала Аисхани Аатресх за додатна истраживања и извештавање о овом чланку. Ја сам оснивач СинБиоБета, а неке од компанија о којима пишем су спонзори СинБиоБета конференција. За више садржаја, можете се претплатити на мој недељни билтен.